Augmentation à long terme en matière de recyclage de l'eau pourraient réduire les impacts humains sur les écosystèmes aquatiques sensibles. Recycler l'eau réduit retrait ou l'épuisement des aquifères souterrains, qui, dans les régions côtières, aide à prévenir l'eau salée d'envahir et de contaminer l'eau douce, selon l'EPA. Cela signifie également que moins d'eau est détournée de sources d'eau de surface comme les rivières et réservoirs construits. Le fleuve Colorado, qui a été tarit et est prévu pour perdre jusqu'à 20 pour cent plus de son volume d'ici 2050, selon l'article de 2010 «Le fleuve Colorado est à sec» du site Web de la Smithsonian Magazine, est complètement consommé avant qu'il atteigne le océan, qui influe sur la santé écologique de l'ensemble de l'écosystème. En outre, les eaux usées non traitées peuvent causer des dommages écologiques comme il est évacué dans les rivières, les estuaires ou les environnements océaniques.