Le registre est organisé par les touches de la même manière que votre disque est organisé par dossiers. Le registre a cinq de haut niveau, ou de la racine, les clés et chaque clé peut avoir d'autres inférieure clés et des valeurs à l'intérieur. Les cinq touches principales ont des noms très longs: HKEY_USERS, HKEY_CURRENT_USER, HKEY_LOCAL_MACHINE, HKEY_CLASSES_ROOT, HKEY_CURRENT_CONFIGURATION. Ces noms sont généralement abrégé à HKU, HKCU, HKCR, HKLM et HKCC dans la documentation sur le registre.